上海交通大學生命科學技術學院擁有微生物代謝國家重點實驗室、教育部代謝與發育科學國際合作聯合實驗室、實驗儀器平台等多個重點實驗室和支撐平台，並以微生物代謝國家重點實驗室爲核心，在國際上系統地率先提出了“代謝科學”的理念，組建了“上海合成生物學創新戰略聯盟”，搭起了具有國際水准的産學研協同創新基地，爲新型微生物藥物等高端生物制造業的創新發展提供了理論指導和技術支撐。

依托對于微生物次級代謝産物合成途徑認識的飛躍，生命科學技術學院有的放矢地建立了重要抗生素等天然藥物的高産策略，並與河南中煙、泰興市東聖生物科技、濱化集團、中石油集團等多家企業開展合作，多渠道推動橫向産學研轉化，繼續推動大的應用型成果轉化，極大地提升了我國相關産業的國際競爭力。

我院教师获得授權專利总数达300余项，“高等真菌和植物的次级代谢物发酵过程调控”等项目先后获得了国家自然科学奖、教育部科技成果一等奖，教育部自然科学一等奖、上海市科技进步一等奖等多个奖项; 在微生物抗生素合成生物学、精神遗传与骨骼遗传疾病等研究领域处于国际前沿水平。